福建武夷山甜槠不同世代种群遗传多样性的SSR分析

doi:10.7525/j.issn.1673-5102.2014.05.014

植物研究 ›› 2014, Vol. 34 ›› Issue (5): 671-677.doi: 10.7525/j.issn.1673-5102.2014.05.014

福建武夷山甜槠不同世代种群遗传多样性的SSR分析

周晓丽¹；杨青²；丁晖³；方炎明^1*；徐海根³；陈晓²

1.南京林业大学森林资源与环境学院，南京　210037；2.武夷山生物研究所，武夷山　354300；3.环境保护部南京环境科学研究所，南京　210044

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2014-09-20 发布日期:2015-03-19
通讯作者: 方炎明
基金资助:

SSR Analysis on Genetic Diversity of Different Generations in Castanopsis eyrei from Wuyishan,Fujian Province

ZHOU Xiao-Li;YANG Qing;DING Hui;FANG Yan-Ming*;XU Hai-Gen;CHEN Xiao

1.College of Forest Resources and Environment,Nanjing Forest University,Nanjing　210037；2.Wuyishan Institute of Biology,Wuyishan　354300；3.Nanjing Institute of Environmental Sciences,Ministry of Environmental Protection,Nanjing　210044

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2014-09-20 Published:2015-03-19
Contact: FANG Yan-Ming
Supported by:

摘要/Abstract

摘要： 按胸径将福建武夷山大安源样地的甜槠(Castanopsis eyrei)群体划分为成体、小树、幼苗3个世代，利用SSR分子标记对不同世代的甜槠遗传多样性及遗传分化进行分析，旨在揭示其不同世代间的遗传变异规律，为甜槠资源的保护与利用提供科学依据。14对SSR引物共检测到92个等位基因，平均每位点的等位基因数A=6.571 4,居群的平均有效等位基因数A_e=3.905 4,平均期望杂合度H_e=0.722 9,表明甜槠群体具有丰富的遗传变异。SSR分析显示3个世代的A_e、H_e、Nei指数(h)、Shannon信息指数(I)均以幼苗最高，小树次之，成体最低，幼苗的遗传多样性指数高于成体及小树，且幼苗中出现最多的稀有等位基因数，表明甜槠种群世代间的遗传多样性呈稳定上升趋势。分子方差分析（AMOVA）表明甜槠群体不同世代内、世代间均存在遗传变异，但遗传变异主要存在于世代内。SSR分析显示，甜槠不同世代间的遗传分化系数F_st=0.074 3，基因流N_m=3.115 4。甜槠不同世代间的遗传相似度以成体与幼苗最小，遗传距离以成体与幼苗间最大。基于甜槠群体SSR的研究结果，认为自然保护区的建立对物种遗传多样性的保护具有重要作用，并提出在遗传多样性保护中应注重保护成体和幼苗中稀有的等位变异。

关键词: 甜槠, 世代, 遗传多样性, 遗传分化, SSR

Abstract: The populations of Castanopsis eyrei collected from Daanyuan plots in Wuyishan city, Fujian province were divided into 3 generations according to the size class, i.e. adults, juveniles, seedlings. A total of 92 alleles were detected with 14 pairs of SSR primers, and a mean of 6.571 4 alleles were detected with per pair primer. The mean effective number of alleles (A_e) and expected heterozygosity (H_e) at population level were 3.905 4 and 0.722 9, respectively. These data suggested that the genetic diversity of C.eyrei was quite high. SSR analyses showed that the highest effective number of alleles (A_e), expected heterozygosity (H_e), Nei index, Shannon information index were detected in seedlings, juveniles took the second place and the lowest were detected in adults. The most rare alleles was found in seedlings. It suggested that the trend of genetic diversity of the population of C.eyrei was in ascension. Analysis of molecular variance (AMOVA) showed that the genetic diversity might exist within and among different generations of C.eyrei populations, but mainly exist within generations. SSR analyses showed that gene differentiation coefficient (F_st) among generations of C.eyrei populations was 0.074 3 while the gene flow (N_m) was 3.115 4. The genetic identity between adults and seedlings was the lowest. The genetic distance between adults and seedlings was the highest. Based on the analysis of SSR, establishment of nature reserve and conservation of the rare alleles in seedlings and adults is of great importance.

Key words: Castanopsis eyrei, generation, genetic diversity, genetic differentiation, SSR

中图分类号:

周晓丽;杨青;丁晖;方炎明*;徐海根;陈晓. 福建武夷山甜槠不同世代种群遗传多样性的SSR分析[J]. 植物研究, 2014, 34(5): 671-677.

ZHOU Xiao-Li;YANG Qing;DING Hui;FANG Yan-Ming*;XU Hai-Gen;CHEN Xiao. SSR Analysis on Genetic Diversity of Different Generations in Castanopsis eyrei from Wuyishan,Fujian Province[J]. Bulletin of Botanical Research, 2014, 34(5): 671-677.

[1]	蔡圆圆, 夏季奔奔, 应文涵, 王洁瑶, 谢涛, 邢孔丫, 冯宣军, 华学军. 拟南芥线粒体蛋白突变体ssr1-2表型的详细鉴定与分析[J]. 植物研究, 2023, 43(3): 421-431.
[2]	杨磊, 曹秋梅, 冯缨, 李文军. 珍稀濒危植物阜康阿魏的遗传多样性及遗传结构[J]. 植物研究, 2023, 43(1): 51-58.
[3]	常二梅, 刘建锋, 黄跃宁, 李红丽, 单冰燕, 江泽平, 赵秀莲. 岷江柏野生居群和迁地保护居群的遗传多样性比较[J]. 植物研究, 2022, 42(5): 772-779.
[4]	张玉洁, 石鹏霞, 赵凡, 陈晓丹, 孙坤, 张辉. rpl32-trnL片段在柳穿鱼不同地理居群遗传多样性分析中的应用[J]. 植物研究, 2022, 42(5): 780-789.
[5]	付鹏程, 韦秋前, 史明艳. 青藏高原岷县龙胆的遗传分化与种群动态历史分析[J]. 植物研究, 2022, 42(4): 556-564.
[6]	段义忠, 王海涛, 张格格, 严伟娜. 基于ISSR分子标记的孑遗濒危植物四合木遗传结构分析[J]. 植物研究, 2021, 41(3): 466-473.
[7]	李振, 仲崇禄, 张勇, 魏永成, 孟景祥. 木麻黄SSR-PCR反应体系的建立与优化[J]. 植物研究, 2021, 41(2): 312-320.
[8]	吕冬雪, 张学杰, 张洛艳, 樊守金. 基于SSR技术对黄河三角洲二色补血草遗传多样性研究[J]. 植物研究, 2020, 40(6): 923-931.
[9]	宁馨, 姜小龙, 邓敏, 徐刚标. 基于简化基因组数据开发岭南青冈微卫星引物[J]. 植物研究, 2020, 40(4): 629-634.
[10]	管睿婷, 刘济明, 王敏, 陈敬忠, 武梦瑶, 童炳丽. 不同天然居群小蓬竹的遗传多样性[J]. 植物研究, 2019, 39(5): 740-751.
[11]	袁佳秋, 田野, 洑香香. 基于EST-SSR标记的南方型黑杨主栽无性系鉴定及亲缘关系分析[J]. 植物研究, 2019, 39(5): 770-778.
[12]	郭文丽, 李义良, 赵奋成, 铁军, 廖仿炎, 钟岁英, 林昌明, 叶威方. 湿加松无性系表型遗传多样性研究[J]. 植物研究, 2019, 39(2): 259-266.
[13]	刘济明, 管睿婷, 王敏, 陈敬忠, 童炳丽, 武梦瑶. 不同喀斯特小生境中小蓬竹的遗传多样性[J]. 植物研究, 2019, 39(1): 69-77.
[14]	蔡年辉, 许玉兰, 王亚楠, 陈诗, 汪梦婷, 李根前. 基于SSR标记的不同优势等级云南松遗传多样性分析[J]. 植物研究, 2019, 39(1): 87-95.
[15]	周玉敏, 王遂, 刘轶, 李开隆, 由香玲. 小黑杨基因组的初步组装及SSR信息分析[J]. 植物研究, 2019, 39(1): 156-160.

福建武夷山甜槠不同世代种群遗传多样性的SSR分析

SSR Analysis on Genetic Diversity of Different Generations in Castanopsis eyrei from Wuyishan,Fujian Province

PDF (PC)

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价