黄芩种质资源ISSR遗传多样性的分析及评价

doi:10.7525/j.issn.1673-5102.2012.01.007

植物研究 ›› 2012, Vol. 32 ›› Issue (1): 32-37.doi: 10.7525/j.issn.1673-5102.2012.01.007

黄芩种质资源ISSR遗传多样性的分析及评价

文苗苗¹;李桂双¹;张龙进¹;郑鹏^1,2;白成科^1,2*

1.陕西师范大学生命科学学院，西安　710062； 2.西北濒危药材资源开发国家工程实验室，西安　710062

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2012-01-20 发布日期:2012-01-20
通讯作者: 白成科
基金资助:

Analysis and Evaluation on Genetic Diversity of Scutellaria baicalensis G. by ISSR Markers

WEN Miao-Miao;LI Gui-Shuang;ZHANG Long-Jin;ZHENG Peng;BAI Cheng-Ke;*

1.College of Life Sciences,Shaanxi Normal University,Xi’an　710062； 2.National Engineering Laboratory for Resource Developing of Endangered Chinese Crude Drugs in Northwest of China,Xi’an　710062

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2012-01-20 Published:2012-01-20
Contact: BAI Cheng-Ke
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摘要/Abstract

摘要： 采用ISSR分子标记技术对6个野生或栽培居群共147份黄芩种质进行遗传多样性分析和评价。分析结果表明，51个ISSR引物中筛选出18条扩增条带清晰、重复性好和多态性高的引物，共扩增出485条清晰的条带，其中466条具有多态性，平均多态性位点比率为96.08%，平均Nei’s基因多样性指数和Shannon’s信息指数分别为0.244 4和0.388 9，等位基因数（Na）和有效等位基因数（Ne）分别为1.993 8和1.383 9，遗传分化指数G_st=0.122 3，遗传一致度（I）和遗传距离（D）分别为0.951 5和0.050 1，说明收集的黄芩种质资源在总体上具有较高的遗传多样性，不同居群间存在一定的遗传分化和基因交流，遗传变异主要存在于居群内。分子聚类结果表明，同一地区的种质并没有按照收集来源完全聚类，可能与种质不同起源或民间栽培引种有关。在DNA分子水平揭示黄芩种质资源的遗传多样性水平，将为进一步黄芩种质资源评价、保存和新品种选育等利用提供依据。

关键词: 黄芩, 种质资源, ISSR, 遗传多样性, 聚类分析

Abstract: To study the genetic diversity of Scutellaria baicalensis G., 147 individuals from six populations were analyzed by inter-simple sequence repeat (ISSR). Eighteen primers were selected to produce highly reproducible ISSR bands. Among 485 amplified bands, 466 showed polymorphism, the percentage of polymorphic bands reached 96.08%. Nei’s gene diversity index and Shannon information index were 0.244 4 and 0.388 9, respectively. Number of alleles (Na) and effective number of alleles (Ne) were 1.993 8 and 1.383 9, respectively. G_st was 0.123 3, genetic identity (I) and genetic distance (D) were 0.951 5 and 0.050 1, respectively. The results showed that the collected germplasm resources of S.baicalensis had a high genetic diversity in general. There was a certain genetic differentiation and gene flow among different populations and the genetic variation was mainly within populations. Molecular clustering results showed that the same region germplasms were not clustered completely following the collection source. It may be related to folk culture introduction or less than normal for ISSR primers. The genetic diversity of S.baicalensis germplasm resources can provide a basis for the evaluation, preservation and breeding of new varieties in the future.

Key words: Scutellaria baicalensis G., germplasm, ISSR, genetic diversity, cluster analysis

中图分类号:

S567.2

文苗苗;李桂双;张龙进;郑鹏;白成科;*. 黄芩种质资源ISSR遗传多样性的分析及评价[J]. 植物研究, 2012, 32(1): 32-37.

WEN Miao-Miao;LI Gui-Shuang;ZHANG Long-Jin;ZHENG Peng;BAI Cheng-Ke;*. Analysis and Evaluation on Genetic Diversity of Scutellaria baicalensis G. by ISSR Markers[J]. Bulletin of Botanical Research, 2012, 32(1): 32-37.

[1]	张淑钧, 杨欣欣, 罗建. 西藏色季拉山区风毛菊属植物花粉形态特征及其分类学意义[J]. 植物研究, 2023, 43(5): 741-755.
[2]	杨磊, 曹秋梅, 冯缨, 李文军. 珍稀濒危植物阜康阿魏的遗传多样性及遗传结构[J]. 植物研究, 2023, 43(1): 51-58.
[3]	胡夏宇, 刘玉萍, 苏旭, 杨萍, 王亚男. 苦豆子不同居群染色体数目及核型分析[J]. 植物研究, 2023, 43(1): 9-19.
[4]	常二梅, 刘建锋, 黄跃宁, 李红丽, 单冰燕, 江泽平, 赵秀莲. 岷江柏野生居群和迁地保护居群的遗传多样性比较[J]. 植物研究, 2022, 42(5): 772-779.
[5]	张玉洁, 石鹏霞, 赵凡, 陈晓丹, 孙坤, 张辉. rpl32-trnL片段在柳穿鱼不同地理居群遗传多样性分析中的应用[J]. 植物研究, 2022, 42(5): 780-789.
[6]	过雪莹, 朱凯琳, 陈昕, 付雪晴, 唐东芹. 6个香雪兰品种的染色体核型及聚类分析[J]. 植物研究, 2022, 42(4): 637-646.
[7]	张捷, 李蓉蓉, 孟景祥, 张勇, 仲崇禄. 我国风铃木类植物叶性状表型变异与遗传多样性研究[J]. 植物研究, 2021, 41(6): 851-861.
[8]	王孟珂, 田梦妮, 毕泉鑫, 刘肖娟, 于海燕, 王利兵. 基于气孔性状的文冠果种质资源抗旱性评价及抗旱资源筛选[J]. 植物研究, 2021, 41(6): 957-964.
[9]	李雁瓷, 付乃峰, 孙加芝, 肖艳, 曹建国, 田代科. 秋海棠（Begonia grandis）的种内表型多样性[J]. 植物研究, 2021, 41(5): 775-788.
[10]	段义忠, 王海涛, 张格格, 严伟娜. 基于ISSR分子标记的孑遗濒危植物四合木遗传结构分析[J]. 植物研究, 2021, 41(3): 466-473.
[11]	吕冬雪, 张学杰, 张洛艳, 樊守金. 基于SSR技术对黄河三角洲二色补血草遗传多样性研究[J]. 植物研究, 2020, 40(6): 923-931.
[12]	宁馨, 姜小龙, 邓敏, 徐刚标. 基于简化基因组数据开发岭南青冈微卫星引物[J]. 植物研究, 2020, 40(4): 629-634.
[13]	吴建慧, 范卫芳, 牛喆, 张静, 高鹏飞, 李文. 外源茉莉酸甲酯对干旱胁迫下狭叶黄芩光合和生理特性的影响[J]. 植物研究, 2020, 40(3): 360-367.
[14]	王胜芳, 韩淑兰, 党士坤, 王慧梅. AgNO₃逆转的黄芩组培玻璃化苗的活性成分含量及其生物活性研究[J]. 植物研究, 2020, 40(3): 401-406.
[15]	李翔, 范作义, 王井源, 王淇, 李喜鹏, 王德秋, 孔令远, 曹森林, 孟庆刚, 赵曦阳. 红松查尔酮合成酶基因CHS密码子偏好性分析[J]. 植物研究, 2020, 40(3): 447-457.

黄芩种质资源ISSR遗传多样性的分析及评价

Analysis and Evaluation on Genetic Diversity of Scutellaria baicalensis G. by ISSR Markers

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