基于查尔酮合酶基因探讨鲜卑花的种群动态历史与遗传分化

doi:10.7525/j.issn.1673-5102.2014.05.018

植物研究 ›› 2014, Vol. 34 ›› Issue (5): 700-705.doi: 10.7525/j.issn.1673-5102.2014.05.018

基于查尔酮合酶基因探讨鲜卑花的种群动态历史与遗传分化

付鹏程^1,3；高庆波¹；张发起¹；陈世龙^1,2*

1.中国科学院高原生物适应与进化重点实验室，中国科学院西北高原生物研究所，西宁　810001；2.青海省作物分子育种重点实验室，西宁　810001；3.中国科学院大学，北京　100049

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2014-09-20 发布日期:2015-03-19
通讯作者: 陈世龙
基金资助:

Demography History and Genetic Divergence of Sibiraea laevigata(Rosaceae) Based on Chalcone Synthase Gene

FU Peng-Cheng;GAO Qing-Bo;ZHANG Fa-Qi;CHEN Shi-Long;*

1.Key Laboratory of Adaptation and Evolution of Plateau Biota,Northwest Institute of Plateau Biology,Chinese Academy of Sciences,Xining　810001；2.Qinghai Province Key Laboratory of Crop Molecular Breeding,Xining　810001；3.University of Chinese Academy of Sciences,Beijing　100049

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2014-09-20 Published:2015-03-19
Contact: CHEN Shi-Long
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摘要/Abstract

摘要： 以高山灌木鲜卑花为研究材料，收集其在中国全部分布区域内的13个居群共139个个体，以查尔酮合酶基因（CHS）的内含子区域为分子标记，探讨鲜卑花的种群动态历史、遗传分化的时间与成因。在鲜卑花中CHS共鉴定了29种单倍型，单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.924 8和0.007 545，遗传变异大；贝叶斯分析说明鲜卑花种内遗传分化的时间始于4.37 Ma左右。中性检验与歧点分布分析一致表明鲜卑花在近期经历了明显的居群扩张，估算的扩张时间在55.8 ka左右。研究结果表明鲜卑花在末次冰期间冰阶时期从冰期避难所向外经历了明显的居群扩张；而青藏高原的整体隆升导致的环境剧变，加剧了鲜卑花居群间的遗传分化。

关键词: 鲜卑花, 种群动态历史, 遗传分化, 查尔酮合酶

Abstract: The demography history and genetic divergence of alpine shrub Sibiraea laevigata were studied with 13 populations (139 individuals) collected in the whole distribution area in China, using the intron of chalcone sythase (CHS) as molecular marker. A total of 29 haplotypes were identified in S.laevigata, indicating high haplotype diversity and nucleotide diversity which were 0.924 8 and 0.007 545, respectively. Bayesian calculation illustrated the genetic divergence in S.laevigata began at around 4.37 Ma, proved that the uplift of Qinghai-Tibetan Plateau triggered the genetic divergence. Neutrality test and mismatch distribution analysis consistently indicated the populations of S.laevigata had experienced recent population expansion at about 55.8 ka.

Key words: Sibiraea laevigata, demography history, genetic divergence, chalcone synthase

中图分类号:

付鹏程;高庆波;张发起;陈世龙;*. 基于查尔酮合酶基因探讨鲜卑花的种群动态历史与遗传分化[J]. 植物研究, 2014, 34(5): 700-705.

FU Peng-Cheng;GAO Qing-Bo;ZHANG Fa-Qi;CHEN Shi-Long;*. Demography History and Genetic Divergence of Sibiraea laevigata(Rosaceae) Based on Chalcone Synthase Gene[J]. Bulletin of Botanical Research, 2014, 34(5): 700-705.

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