广西野生桃金娘SRAP体系优化及建立

doi:10.7525/j.issn.1673-5102.2013.03.015

植物研究 ›› 2013, Vol. 33 ›› Issue (3): 346-350.doi: 10.7525/j.issn.1673-5102.2013.03.015

广西野生桃金娘SRAP体系优化及建立

邱文武¹；韦持章¹；郭凌飞²；杨祥燕³；覃振师¹；王文林^1*

1.广西橡胶研究所龙州　532415；2.厦门市农业机械监理所，厦门　361009；3.广西壮族自治区亚热带作物研究所,南宁　530001

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2013-05-20 发布日期:2013-05-20
通讯作者: 王文林
基金资助:

Optimization of SRAP System for Guangxi Wild Rhodomyrtus tomentosa(Ait.) Hassk.

QIU Wen-Wu;WEI Chi-Zhang;GUO Ling-Fei;YANG Xiang-Yan;QIN Zhen-Shi;WANG Wen-Ling*

1.Guangxi Rubber Research Institute,Longzhou　532415；2.Xiamen Agricultural Machinery Supervision Institute,Xiamen　361009；3.Guangxi Subtropical Crops Research Institute,Nanning　530001

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2013-05-20 Published:2013-05-20
Contact: WANG Wen-Ling
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摘要/Abstract

摘要： 利用均匀设计方法优化了桃金娘SRAP反应体系。得出最佳反应体系，其总反应体积为25 μL，包括2.5 μL 10×PCR buffer，1.0U Taq DNA聚合酶，20 ng模板DNA，0.2 mmol·L^-1 dNTPs，0.3 μmol·L^-1引物，2.5 mmol·L^-1 Mg²⁺。采用优化的扩增体系，以Me1-Em11引物组合对8个参试种质进行SRAP扩增，扩增出的条带清晰、多态性好。所确立的体系稳定可靠，适于进行桃金娘的SRAP遗传分析。

关键词: 桃金娘, 均匀设计, SRAP, 体系优化

Abstract: By the method of uniform design, the reaction system for SRAP marker in Rhodomyrtus tomentosa(Ait.) Hassk. was established and optimized. The results showed that an optimal 25 μL reaction system of SRAP for R.tomentosa included 2.5 μL 10×PCR buffer, 1.0 U Taq DNA polymerase, 20 ng template DNA, 0.2 mmol·L^-1 dNTPs, 0.3 μmol·L^-1 primer and 2.5 mmol·L^-1 Mg²⁺. This optimum reaction system was applied to fingerprint 8 varieties of R.tomentosa accessions by Me1-Em11 primers and produced clear polymorphic patterns. It showed that the optimized system could be effectively applied in the germplasm identification and genetic diversity analysis of R.tomentosa.

Key words: Rhodomyrtus tomentosa(Ait.) Hassk., uniform design, SRAP, system optimization

中图分类号:

S567.9

邱文武;韦持章;郭凌飞;杨祥燕;覃振师;王文林*. 广西野生桃金娘SRAP体系优化及建立[J]. 植物研究, 2013, 33(3): 346-350.

QIU Wen-Wu;WEI Chi-Zhang;GUO Ling-Fei;YANG Xiang-Yan;QIN Zhen-Shi;WANG Wen-Ling*. Optimization of SRAP System for Guangxi Wild Rhodomyrtus tomentosa(Ait.) Hassk.[J]. Bulletin of Botanical Research, 2013, 33(3): 346-350.

[1]	杨立荣, 孙秀秀, 陈加利, 云勇, 陈宣, 郑道君. 海南特有极小种群植物文昌锥的SCoT-PCR体系建立及有效引物评价[J]. 植物研究, 2020, 40(1): 66-72.
[2]	吴春太, 班硕, 黎瑜, 曾日中. 橡胶树MSAP反应体系优化及其不同开割高度单株DNA甲基化分析[J]. 植物研究, 2016, 36(6): 860-869.
[3]	武正前1,2；李雪虎1*；梁剑平1；陆锡宏1；辛志君1；周翔1. 大青叶SRAP-PCR反应体系的建立与优化研究[J]. 植物研究, 2015, 35(2): 310-314.
[4]	邓传良；任映雪；张卫丽；李书粉；高武军；卢龙斗. 葎草性别相关SRAP分子标记的鉴定[J]. 植物研究, 2014, 34(6): 798-802.
[5]	张安世;刘莹;张为民;赵利新. 均匀设计优化太行菊SRAPPCR反应体系[J]. 植物研究, 2014, 34(5): 712-715.
[6]	谢春花;李晓玲*;栾春艳;杨进;陈发菊;李争艳. 湖北河岸带植物中华蚊母树遗传多样性的SRAP分析[J]. 植物研究, 2012, 32(3): 311-319.
[7]	焦培培;王彦芹;庞新安;李志军;*. 濒危物种胡杨和灰叶胡杨总DNA提取及RAPD体系优化[J]. 植物研究, 2012, 32(3): 320-325.
[8]	张飞;王炜勇;张智;田丹青;刘建新;刘晓静. 光萼荷属植物SSR反应体系确立与指纹图谱构建[J]. 植物研究, 2012, 32(1): 115-119.
[9]	罗成;熊宇婷;顾蔚;*;王喆之;. 华中五味子ISSR-PCR反应体系优化及引物筛选[J]. 植物研究, 2010, 30(5): 588-593.
[10]	顾地周;高捍东*;王玉方;冯颖. 不同激素及其浓度配比对深山蔷薇嫩叶柄再生植株诱导的影响[J]. 植物研究, 2010, 30(4): 428-433.
[11]	魏军亚;刘德兵;魏守兴;谢子四;陈业渊*. 香蕉基因组SRAP反应体系的建立和优化[J]. 植物研究, 2009, 29(3): 352-356.
[12]	王雯雯;马秋月;朱俊义;顾地周*. 大字杜鹃离体快繁体系建立及种质试管保存研究[J]. , 2009, 29(2): 198-203.
[13]	郑道君;刘国民;*;梁远发;鄢东海;令狐昌弟;田永辉. 中国木犀科苦丁茶ISSR实验条件优化的研究[J]. 植物研究, 2009, 29(2): 234-241.
[14]	赵丽萍;柳李旺;*;龚义勤;王明霞;郁樊敏;汪隆植. 萝卜品种指纹图谱SRAP与AFLP分析[J]. 植物研究, 2007, 27(6): 687-693.
[15]	龚义勤;李　培;王明霞;赵丽萍;柳李旺*. 萝卜基因组DNA的RAMP-PCR体系优化[J]. 植物研究, 2006, 26(1): 93-97.

广西野生桃金娘SRAP体系优化及建立

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