海南部分荔枝种质资源亲缘关系的SSR分析

doi:10.7525/j.issn.1673-5102.2009.05.022

植物研究 ›› 2009, Vol. 29 ›› Issue (5): 628-632.doi: 10.7525/j.issn.1673-5102.2009.05.022

海南部分荔枝种质资源亲缘关系的SSR分析

姚庆荣¹;赵长增²;王文泉^3*

(1.甘肃行政学院，兰州730010) (2.甘肃农业大学农学院，兰州730070) (3.中国热带农业科学院热带生物技术研究所，海口571101)

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2009-09-20 发布日期:2009-09-20
通讯作者: 王文泉
基金资助:

Analysis of Genetic Relationship of Hainan Litchi Germplasm Resources by SSR Marker

YAO Qing-Rong;ZHAO Chang-Zeng;WANG Wen-Quan*

(1.Gansu Administration Institute,Lanzhou730070) (2.College of agronomy,Gansu Agricultural University,Lanzhou730070) (3.Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology,CATAS,Haikou571101)

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2009-09-20 Published:2009-09-20
Contact: WANG Wen-Quan
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摘要/Abstract

摘要： 利用SSR标记对22份荔枝材料进行了亲缘关系分析，从32对引物中筛选出22对多态性引物用于荔枝SSR扩增，共扩增到52条带，其中多态性条带49条，多态性百分率为94.23%。多态性条带经POPGENE32软件统计分析表明，22个位点的平均有效等位基因频率（Ne）、平均基因杂合度（H）、平均Shannon遗传多样性指数（H_i′）分别为1.364 3、0.296 0、0.417 0。通过NTSYS聚类结果显示，在相似系数为0.51处，供试材料被聚为两大类，第一类包括13份材料，又可分为两个亚类，第二类包括9份材料。

关键词: 荔枝, 亲缘关系, SSR, 海南

Abstract: 22 Litchi germplasm were used as materials for analyzing their genome polymorphism by SSR markers. 22 primers selected from 32 primers were used for SSR amplification. A total of 52 bands were generated, of which 49 bands were polymorphic bands. The percentage of polymorphic band (PPB) was 94.23%. According to the analysis results of POPGENE32 software, the average effective number of alleles(Ne), the Nei’s average gene diversity (H) and the average of Shannon’s genetic diversity(H_i′) index was 1.364 3, 0.296 0 and 0.417 0, respectively. The UPGAM dendrogram gotten by NTNSYS cluster analysis implied that 22 Litchi germplasm resources could be divided into 2 groups on the basis of genetic distance 0.51. The fist group included 13 cultivars. The second group included 9 cultivars.

Key words: Litchi, genetic relationship, SSR, hainan province

中图分类号:

S667.1

姚庆荣;赵长增;王文泉*. 海南部分荔枝种质资源亲缘关系的SSR分析[J]. 植物研究, 2009, 29(5): 628-632.

YAO Qing-Rong;ZHAO Chang-Zeng;WANG Wen-Quan*. Analysis of Genetic Relationship of Hainan Litchi Germplasm Resources by SSR Marker[J]. Bulletin of Botanical Research, 2009, 29(5): 628-632.

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海南部分荔枝种质资源亲缘关系的SSR分析

Analysis of Genetic Relationship of Hainan Litchi Germplasm Resources by SSR Marker

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