盐胁迫下胡杨cDNA文库的构建及其nhx基因的克隆

doi:10.7525/j.issn.1673-5102.2007.01.016

植物研究 ›› 2007, Vol. 27 ›› Issue (1): 82-88.doi: 10.7525/j.issn.1673-5102.2007.01.016

盐胁迫下胡杨cDNA文库的构建及其nhx基因的克隆

朱馨蕾¹;马艳²;张富春^1*

(1.新疆大学生命科学与技术学院分子生物学重点实验室，新疆生物资源基因工程重点实验室，乌鲁木齐830046) (2.河北科技师范大学，秦皇岛 066004)

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2007-01-20 发布日期:2007-01-20
通讯作者: 张富春
基金资助:

Construction of a cDNA Library and Cloning of nhx cDNA from Populus euphratica under Salt Stress

ZHU Xin-Lei;MA Yan;ZHANG Fu-Chun*

(1.Key Laboratory of Molecular Biology,College of Life Science and Technology,Xinjiang Key Laboratory of Biological Resources and Genetic Engineering,Xinjiang University,Urumqi 830046) (2.Hebei Normal University of Science and Technology,Qinghuangdao 066004)

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2007-01-20 Published:2007-01-20
Contact: ZHANG Fu-Chun
Supported by:

摘要/Abstract

摘要： 采用CTAB法提取经600 mmol·L^-1 NaCl胁迫处理后的胡杨总RNA，利用SMART技术构建载体为λTriplEx2的盐胁迫条件下胡杨的表达型cDNA文库（SSL）。文库的滴度为1.2×10⁶ pfu·ml^-1，重组率约为90.6%，扩增后的滴度为3×10⁹ pfu·ml^-1，容量约为2.4×10¹¹。插入片段长度均大于400 bp，平均长度约为790 bp。从文库中随机挑选32个阳性克隆进行3′端测序，并将测序结果通过NCBI (National Center for Biotechnology Information) 数据库进行比较，发现有23个EST序列与已知序列有明显的同源性，而其余的与NCBI中的已知序列相似性较低（e值>10^-4）,可能是未知基因。其中序列SSL061、SSL179与脱水素序列有较高的序列一致性。同时合成引物，通过PCR扩增文库的方法，从中筛选获得存在于植物细胞膜上并在植物受盐胁迫时起重要作用的nhx基因，进一步验证了文库的质量。

关键词: 胡杨, 盐胁迫, cDNA文库, nhx

Abstract: The total RNA was extracted from Populus euphratica under salt stress with the 600mmol·L^-1 NaCl treatment, and then the cDNA library was constructed by SMART technique, which uses λTriplEx2 as a vector. The estimated titer and the percentage for the unamplified salt stress library (SSL) is 1.2×10⁶ pfu·ml^-1 and 90.6%. Selected cDNA clones randomly and the EST were obtained by 3′ sequenced, these sequences were compared in GenBank databases. 32 Expressed Sequence Taqs (ESTs) were gained from the SSL with high homologous sequences, 71.8% are assigned putative identities. The sequences from the remaining clones showed either significant similarity to protein or DNA sequences that were of unknown function or no significant similarity to any other sequences in the databases. Two of the SSL transcripts encoding dehydrin may be connected with salt stress. Meanwhile, two primers of nhx were synthesized and the full length nhx cDNA of Populus euphratica was successfully obtained from this library to identify the high quality library using PCR.

Key words: Populus euphratica, salt stress, cDNA library, nhx

中图分类号:

朱馨蕾;马艳;张富春*. 盐胁迫下胡杨cDNA文库的构建及其nhx基因的克隆[J]. 植物研究, 2007, 27(1): 82-88.

ZHU Xin-Lei;MA Yan;ZHANG Fu-Chun*. Construction of a cDNA Library and Cloning of nhx cDNA from Populus euphratica under Salt Stress[J]. Bulletin of Botanical Research, 2007, 27(1): 82-88.

[1]	隋德宗, 王保松. 盐胁迫下乌桕无性系叶片的比较蛋白组学研究[J]. 植物研究, 2023, 43(5): 679-689.
[2]	徐磊, 胥晓, 刘沁松. 外源水杨酸对盐胁迫下珙桐幼苗抗氧化系统和基因表达的影响[J]. 植物研究, 2023, 43(4): 572-581.
[3]	廖诗贤, 王宇婷, 董立本, 顾咏梅, 贾丰璘, 姜廷波, 周博如. 小黑杨转录因子PsnbZIP1应答盐胁迫功能分析[J]. 植物研究, 2023, 43(2): 288-299.
[4]	刘森尧, 贾丰璘, 国庆, 樊高锋, 周博如, 姜廷波. 小黑杨转录因子PsnbHLH162基因在盐和低温胁迫下应答分析[J]. 植物研究, 2023, 43(2): 300-310.
[5]	岳莉然, 刘颖婕, 刘晨旭, 周蕴薇. 响应盐胁迫调控的露地菊miR398a的克隆及功能研究[J]. 植物研究, 2022, 42(6): 986-996.
[6]	李登高, 林睿, 穆青慧, 周娜, 张焱如, 白薇. 马铃薯StNPR4基因的克隆与功能分析[J]. 植物研究, 2022, 42(5): 821-829.
[7]	陈娇娆, 续旭, 胡章立, 杨爽. 植物感受盐胁迫及相关钙信号的研究进展[J]. 植物研究, 2022, 42(4): 713-720.
[8]	程赫, 田双慧, 张洋, 刘聪, 夏德安, 魏志刚. 毛果杨nsLTP基因家族全基因组水平鉴定及其表达特性分析[J]. 植物研究, 2022, 42(3): 412-423.
[9]	谢望, 李天静, 李鑫窈, 杨丰铭, 姚银安, 高永峰. 胡杨PeNAC121基因启动子的分离鉴定和胁迫应答模式分析[J]. 植物研究, 2022, 42(2): 234-242.
[10]	代雅琦, 刘艳萍, 韩路, 王海珍. 地下水埋深对胡杨叶片光合作用及抗氧化物质积累的影响[J]. 植物研究, 2022, 42(2): 299-308.
[11]	田双慧, 程赫, 张洋, 刘聪, 夏德安, 魏志刚. 毛果杨类胡萝卜素裂解双加氧酶基因家族全基因组水平鉴定及其干旱与盐胁迫响应分析[J]. 植物研究, 2021, 41(6): 993-1005.
[12]	赵晓菊, 张奕婷, 刘佳, 刘洋, 唐中华. 一氧化氮参与盐胁迫下长春花酚类代谢的调控研究[J]. 植物研究, 2021, 41(4): 633-640.
[13]	任梦轩, 张洋, 王爽, 王瑞琪, 刘聪, 魏志刚. 毛果杨GATA基因家族全基因组水平鉴定及表达分析[J]. 植物研究, 2021, 41(1): 107-118.
[14]	曹明武, 罗蕊, 安慧, 庞秋颖. 菊芋悬浮细胞对盐胁迫的生理响应[J]. 植物研究, 2019, 39(2): 222-228.
[15]	赵晓菊, 张丽霞, 满秀玲. NO对盐胁迫下长春花种子萌发和幼苗生理代谢的影响[J]. 植物研究, 2018, 38(5): 669-674.

盐胁迫下胡杨cDNA文库的构建及其nhx基因的克隆

Construction of a cDNA Library and Cloning of nhx cDNA from Populus euphratica under Salt Stress

PDF (PC)

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价