宽果苁菔适应昼夜变化ESTs的分离与分析

doi:10.7525/j.issn.1673-5102.2012.04.008

植物研究 ›› 2012, Vol. 32 ›› Issue (4): 420-424.doi: 10.7525/j.issn.1673-5102.2012.04.008

宽果苁菔适应昼夜变化ESTs的分离与分析

刘德团；李婉莎；胡向阳^*

中国科学院昆明植物研究所，昆明　650204

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2012-07-20 发布日期:2012-07-20
通讯作者: 胡向阳
基金资助:

Isolation and Analysis of Differential Expressed ESTs from Solms-laubachia eurycarpa(Maxim.) Botsch. between Day and Night

LIU De-Tuan;LI Wan-Sha;HU Xiang-Yang*

Kunming Institute of Botany,Chinese Academy of Sciences,Kunming　650204

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2012-07-20 Published:2012-07-20
Contact: HU Xiang-Yang
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摘要/Abstract

摘要： 以流石滩地区植物广布种宽果苁菔为实验材料，应用磁珠介导的抑制消减杂交方法，分离昼夜差异基因。随机挑选了136个差异ESTs克隆并进行测序，测序结果使用Blast2go程序进行功能注释和分析。结果表明绝大部分ESTs功能与稳定细胞状态和抗性响应相关，其次与物质能量代谢和信号传导相关，宽果苁菔适应昼夜变化过程的机制非常复杂，本研究为进一步研究高山植物适应流石滩恶劣环境的机制奠定了基础。

关键词: 差异表达, 表达序列标签, 宽果苁菔, 抑制消减杂交

Abstract: The wide-distribution species Solms-laubachia eurycarpa on the scree on Baima snow mountain was used as the experimental material, and the suppression subtractive hybridization (SSH) based on magnetic beads technology was used to isolate the differential genes between day and night. After randomly sequencing 136 differential ESTs, these ESTs were further analyzed by functional annotation by Blast2go. Our results show that most ESTs are related to cellular homeostasis and stress response, followed by material and energy metabolism, and signal transduction. The process of S-L.eurycarpa responsive to daytime environment is very complicated, which lays a good foundation for further studying alpine plants adaptation to harsh environments of scree.

Key words: differential expression, EST, Solms-laubachia eurycarpa, suppression subtractive hybridization(SSH)

中图分类号:

Q949.748.3

刘德团;李婉莎;胡向阳*. 宽果苁菔适应昼夜变化ESTs的分离与分析[J]. 植物研究, 2012, 32(4): 420-424.

LIU De-Tuan;LI Wan-Sha;HU Xiang-Yang*. Isolation and Analysis of Differential Expressed ESTs from Solms-laubachia eurycarpa(Maxim.) Botsch. between Day and Night[J]. Bulletin of Botanical Research, 2012, 32(4): 420-424.

[1]	李博, 刘合霞, 刘秦, 周兴文. 金花茶花瓣转录组分析及花瓣发育调控基因挖掘[J]. 植物研究, 2021, 41(4): 573-587.
[2]	朱利利, 杜庆鑫, 何凤, 庆军, 杜红岩. 杜仲雄花芽2个发育时期转录组分析[J]. 植物研究, 2020, 40(2): 284-292.
[3]	蒋海港, 王树刚, 刘阳, 沈彦合, 李祥宁, 曹颖. 基于转录组测序的慈竹笋木质素基因筛选及其表达分析[J]. 植物研究, 2018, 38(3): 415-421.
[4]	乔石瑶；刘晓颖；王艳红；肖莹；孙世南；王振英*. 栽培小麦Brock白粉菌诱导早期应答基因SSH文库构建及分析[J]. 植物研究, 2015, 35(1): 60-67.
[5]	秦玥;傅大立;*;吴硕;刘梦培;朱高浦;赵罕;马履一. 华仁杏EST-SSR标记引物设计与开发[J]. 植物研究, 2013, 33(4): 517-520.
[6]	武芸芸;田璐;朱永平;和凤美*. 莲瓣王捧瓣与舌瓣SSH文库构建及EST序列分析[J]. 植物研究, 2012, 32(2): 222-226.
[7]	刘德团;李婉莎;查宏光;杨永平;胡向阳*. 拟耧斗菜昼夜差异表达ESTs的分离与分析[J]. 植物研究, 2011, 31(4): 414-421.
[8]	王　超;杨传平*;魏继承;姜　静. 白桦雌花序抑制性消减文库构建及EST分析[J]. 植物研究, 2008, 28(3): 293-298.
[9]	董玉芝;杨传平*;王玉成;张道远. 渗透胁迫下白花柽柳消减文库的构建及分析[J]. 植物研究, 2006, 26(3): 302-307.
[10]	刘桂丰, 侯英杰, 王玉成, 褚延广. 干旱胁迫下刚毛柽柳消减文库的构建及分析[J]. 植物研究, 2005, 25(1): 69-73.
[11]	李同祥, 王进科. 基因芯片与植物基因差异表达分析[J]. 植物研究, 2002, 22(3): 310-313.

宽果苁菔适应昼夜变化ESTs的分离与分析

Isolation and Analysis of Differential Expressed ESTs from Solms-laubachia eurycarpa(Maxim.) Botsch. between Day and Night

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