拟耧斗菜昼夜差异表达ESTs的分离与分析

doi:10.7525/j.issn.1673-5102.2011.04.007

植物研究 ›› 2011, Vol. 31 ›› Issue (4): 414-421.doi: 10.7525/j.issn.1673-5102.2011.04.007

拟耧斗菜昼夜差异表达ESTs的分离与分析

刘德团^1,2；李婉莎¹；查宏光¹；杨永平¹；胡向阳^1*

1.中国科学院昆明植物研究所，昆明　650204；2.中国科学院研究生院，北京　100049

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2011-07-20 发布日期:2011-07-20
通讯作者: 胡向阳
基金资助:

Isolation and Analysis of Day-night Differential Expressed ESTs from Paraquilegia microphylla

LIU De-Tuan;LI Wan-Sha;ZHA Hong-Guang;YANG Yong-Ping;HU Xiang-Yang*

1.Kunming Institute of Botany,Chinese Academy of Sciences,Kunming　650204；2.Graduate University of Chinese Academy of Sciences,Beijing　100049

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2011-07-20 Published:2011-07-20
Contact: HU Xiang-Yang1
Supported by:

摘要/Abstract

摘要： 应用磁珠介导的抑制消减杂交方法，以青藏高原白马雪山流石滩地区植物拟耧斗菜为实验材料，分别在白天与夜晚采样，以白天样品为目标，晚上样品为驱动样品，分离昼夜差异表达的基因。随机挑选了96个差异ESTs克隆并进行测序，测序结果进行blastx网上数据库比对、Blast2go功能注释和KEGG代谢路径分析。结果表明：绝大部分ESTs功能与物质能量代谢、生物合成、蛋白和核酸结合、转移酶活性相关，还有少数与逆境胁迫相关等。这为进一步研究高山植物逆境适应的分子机制奠定了基础。

关键词: 高山植物, 胁迫, 抑制消减杂交

Abstract: Suppression subtractive hybridization (SSH) based on magnetic beads technology was used to screen day-night differential expression genes of Paraquilegia microphylla living on the scree of the Baima snow mountain of Tibetan plateau. The daytime sample was used as tester and nighttime sample as driver for further analysis. Finally, 96 differential ESTs between two samples were sequenced. Sequences were analyzed with BlastX, Blast2go and KEGG. The results indicated that most differential expression proteins are related to material and energy metabolism, biosynthetic process, have nucleic acid binding, protein binding and transferase activity; and a few are responsive to stress, etc. These results will provide some prerequisites for further researches on alpine plants under harsh environments.

Key words: alpine plant, stress, suppression subtractive hybridization(SSH)

中图分类号:

刘德团;李婉莎;查宏光;杨永平;胡向阳*. 拟耧斗菜昼夜差异表达ESTs的分离与分析[J]. 植物研究, 2011, 31(4): 414-421.

LIU De-Tuan;LI Wan-Sha;ZHA Hong-Guang;YANG Yong-Ping;HU Xiang-Yang*. Isolation and Analysis of Day-night Differential Expressed ESTs from Paraquilegia microphylla[J]. Bulletin of Botanical Research, 2011, 31(4): 414-421.

[1]	周露华, 方俊仪, 熊子墨, 巫伟峰, 刘佳瑞, 陆乔, 凌宏清, 孔丹宇. 不同番茄种质的耐涝能力评价[J]. 植物研究, 2023, 43(5): 657-666.
[2]	隋德宗, 王保松. 盐胁迫下乌桕无性系叶片的比较蛋白组学研究[J]. 植物研究, 2023, 43(5): 679-689.
[3]	单超然, 陈晓慧, 丁云飞, 赵威, 卢晗, 高尚珠, 齐凤慧, 詹亚光, 曾凡锁. 水曲柳FmCCoAOMT基因在木质素合成及非生物胁迫中的功能分析[J]. 植物研究, 2023, 43(5): 768-778.
[4]	庄舒尧, 许恒博, 胡骁彧, 戴上, 张彦妮. 盐碱胁迫对彩叶矾根‘银扇’幼苗生长和生理特性的影响[J]. 植物研究, 2023, 43(4): 520-530.
[5]	徐磊, 胥晓, 刘沁松. 外源水杨酸对盐胁迫下珙桐幼苗抗氧化系统和基因表达的影响[J]. 植物研究, 2023, 43(4): 572-581.
[6]	孙宇, 张艺腾, 成慧慧. 紫穗槐WRKY42基因耐盐碱性的功能研究[J]. 植物研究, 2023, 43(4): 612-621.
[7]	廖诗贤, 王宇婷, 董立本, 顾咏梅, 贾丰璘, 姜廷波, 周博如. 小黑杨转录因子PsnbZIP1应答盐胁迫功能分析[J]. 植物研究, 2023, 43(2): 288-299.
[8]	刘森尧, 贾丰璘, 国庆, 樊高锋, 周博如, 姜廷波. 小黑杨转录因子PsnbHLH162基因在盐和低温胁迫下应答分析[J]. 植物研究, 2023, 43(2): 300-310.
[9]	刘建新, 刘瑞瑞, 刘秀丽, 欧晓彬, 贾海燕, 卜婷, 李娜. 外源硫化氢对盐碱胁迫下裸燕麦叶片有机酸和激素含量的影响[J]. 植物研究, 2023, 43(1): 76-89.
[10]	李登高, 林睿, 穆青慧, 周娜, 张焱如, 白薇. 马铃薯StCRKs基因家族的鉴定分析及响应逆境信号的表达[J]. 植物研究, 2022, 42(6): 1033-1043.
[11]	吴静, 王媛媛, 王丹妮, 刘百超, 刘中原. 刚毛柽柳ThGRF2基因的克隆和渗透胁迫应答分析[J]. 植物研究, 2022, 42(6): 1044-1051.
[12]	岳莉然, 刘颖婕, 刘晨旭, 周蕴薇. 响应盐胁迫调控的露地菊miR398a的克隆及功能研究[J]. 植物研究, 2022, 42(6): 986-996.
[13]	钟鑫爱, 孟诗琪, 周婉婷, 姚琦, 张琼, 兴旺, 刘大丽. 甜菜谷胱甘肽S-转移酶基因家族鉴定及在镉胁迫下的响应分析[J]. 植物研究, 2022, 42(5): 790-801.
[14]	李登高, 林睿, 穆青慧, 周娜, 张焱如, 白薇. 马铃薯StNPR4基因的克隆与功能分析[J]. 植物研究, 2022, 42(5): 821-829.
[15]	覃碧, 王肖肖, 杨玉双, 聂秋海, 陈秋惠, 刘实忠. 橡胶草TkAPC10基因的鉴定及其表达模式分析[J]. 植物研究, 2022, 42(5): 830-839.

拟耧斗菜昼夜差异表达ESTs的分离与分析

Isolation and Analysis of Day-night Differential Expressed ESTs from Paraquilegia microphylla

PDF (PC)

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价