橡胶草HMGR基因的克隆及表达分析

doi:10.7525/j.issn.1673-5102.2012.01.011

植物研究 ›› 2012, Vol. 32 ›› Issue (1): 61-68.doi: 10.7525/j.issn.1673-5102.2012.01.011

橡胶草HMGR基因的克隆及表达分析

王启超^1,2;刘实忠¹;校现周^1,2*

1.海南大学园艺园林学院，海口　571737； 2.中国热带农业科学院橡胶研究所，海口　571737

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2012-01-20 发布日期:2012-01-20
通讯作者: 校现周
基金资助:

Cloning and Expression Analysis of HMGR Gene from Taraxacum kok-saghyz

WANG Qi-Chao;LIU Shi-Zhong;XIAO Xian-Zhou;*

1.College of Horticulture and Landscape Architecture,Hainan University,Haikou　571737； 2.Rubber Research Institute,CATAS,Haikou　571737

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2012-01-20 Published:2012-01-20
Contact: XIAO Xian-Zhou
Supported by:

摘要/Abstract

摘要： 通过比较9种植物的9条甲羟戊酸途径关键酶3-羟基-3甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶（HMGR）氨基酸同源区域，设计简并引物，利用RT-PCR和RACE技术首次从橡胶草（Taraxacum kok-saghyz）中克隆了一个HMGR基因，命名为TKHMGR。通过氨基酸序列同源性比对与系统进化分析表明，TKHMGR属于HMGR基因家族的新成员。同时，利用荧光定量方法分析了该基因在不同组织的表达情况。

关键词: 橡胶草, HMGR, 基因克隆, 序列分析, 荧光定量

Abstract: Based on the design of degenerated oligonucleotides according to the conservative regions of nine 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductases from nine plants and the total RNA extracted from Taraxacum kok-saghyz, a HMGR named TKHMGR was first obtained using the techniques of degenerate RT-PCR and RACE. Comparison of the amino acid sequence homology and system evolution analysis show that, TKHMGR belongs to the new members of the HMGR gene families. At the same time, the gene expression in different organizations was analyzed using fluorescence quantitative method. The cloning, bioinformatics analysis and expression analysis of this gene laid a foundation for further research on its function.

Key words: Taraxacum kok-saghyz(TKS), 3-hydroxy-3-methyl-glutaryl-coenzyme A reductase(HMGR), gene cloning, sequence analysis, fluorescence quantitation

中图分类号:

S576

王启超;刘实忠;校现周;*. 橡胶草HMGR基因的克隆及表达分析[J]. 植物研究, 2012, 32(1): 61-68.

WANG Qi-Chao;LIU Shi-Zhong;XIAO Xian-Zhou;*. Cloning and Expression Analysis of HMGR Gene from Taraxacum kok-saghyz[J]. Bulletin of Botanical Research, 2012, 32(1): 61-68.

[1]	熊阳阳, 罗琳莉, 赵士豪, 周安龙, 王锦. 大花铁线莲单重被花的转录组差异分析[J]. 植物研究, 2020, 40(1): 93-105.
[2]	李新宇, 何利明, 詹亚光. 水曲柳FmWRKY44基因克隆及表达分析[J]. 植物研究, 2019, 39(4): 529-538.
[3]	李文静, 冯雨, 侯晓强, 孙艳香, 韩美玲, 李晓雪, 王勇, 向蓓蓓. 川西獐牙菜SmSLS2基因的克隆、生物信息学及表达分析[J]. 植物研究, 2019, 39(3): 431-440.
[4]	丁一巍, 詹亚光, 张佳薇, 何利明. 水曲柳2个PLT转录因子基因的克隆及表达分析[J]. 植物研究, 2019, 39(1): 139-147.
[5]	邵婉璐, 李月灵, 高松, 李钧敏, 梁宗锁. 光照强度对成熟红颜草莓果实着色和花青素生物合成的影响及可能的分子机制[J]. 植物研究, 2018, 38(5): 661-668.
[6]	沈访, 李林, 潘胤池, 张社波, 马激, 徐德林. 白及丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)基因的序列分析[J]. 植物研究, 2018, 38(4): 543-550.
[7]	张雪薇, 刘仑, 鲁黎明, 李立芹. 烟草NtCBL1基因的克隆、表达载体构建及表达分析[J]. 植物研究, 2017, 37(3): 387-394.
[8]	杨凯, 孙迎坤, 王奎玲, 刘庆华, 高捍东. 耐冬山茶抗寒基因CjCor1的全长克隆与表达分析[J]. 植物研究, 2016, 36(5): 753-759.
[9]	叶思诚, 姚小华, 王开良, 林萍, 龚洪恩, 卓仁英. 油茶柠檬酸合成酶(CS)基因的克隆和表达分析[J]. 植物研究, 2016, 36(4): 556-564.
[10]	李晗, 李治龙, 李晓屿, 李玉花, 蓝兴国. 羽衣甘蓝不同组织及柱头发育实时荧光定量PCR内参基因的筛选[J]. 植物研究, 2016, 36(4): 565-572.
[11]	刘慧子；孙丹；于颖；张楠；王超*. 白桦MYB家族基因序列及表达分析[J]. 植物研究, 2016, 36(2): 252-257.
[12]	张晓东1；李彩霞1；王元忠2. 滇龙胆GrCMS*基因的克隆与表达分析[J]. 植物研究, 2016, 36(2): 258-265.
[13]	陈琴1,2；曲延英1,2；刘静静1,2；朱燕飞1,2；姚正培1,2；陈全家1,2. 两种短命植物HRD*转录因子基因的克隆及序列分析[J]. 植物研究, 2015, 35(2): 250-258.
[14]	高刚；邓家彬；苟学梅；王茜；张艳；杨瑞武. 14个赖草属植物DREB2*基因的克隆与SNP分析[J]. 植物研究, 2015, 35(1): 47-51.
[15]	周华1；朱祺1；杨艳芳2；刘洪伟2；余发新1；邱德有2. 南方红豆杉bHLH*基因克隆与序列分析[J]. 植物研究, 2015, 35(1): 52-59.

橡胶草HMGR基因的克隆及表达分析

Cloning and Expression Analysis of HMGR Gene from Taraxacum kok-saghyz

PDF (PC)

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价